综合审计科职责：负责起草内部审计相关制度、文件；负责财务收支审计、科研经费审计、固定资产管理审计、大额资金支付审计、物资采购审计、经济责任审计、内部控制审计、预算执行审计、其它专项等审计或专项审计调查工作；负责职责范围内社会中介机构的委托与管理工作；负责学校内部控制牵头组织工作及评价与监督工作；负责审计项目档案资料的立卷、整理、归档工作；接受上级部门的各类检查 、协助上级部门审计相关工作；负责处内行政综合工作；完成领导交办的其它工作。

基建审计科职责：负责起草内部审计有关工程审计制度、文件；负责学校基本建设项目、修缮项目的结算审计工作；负责学校建设工程管理审计工作；负责对职责范围内社会中介机构的委托与管理；配合财务处对基建工程财务决算的编制、审核工作；提供与工程审计相关的咨询服务；完成领导交办的其它工作。